ISO9001质量管理体系认证首次申请的流程包括以下主要步骤：

确定认证需求

首先，组织需要确定自身是否需要ISO9001认证，以及认证的范围和目标。认证的范围可以是整个组织，也可以是特定部门或业务流程。

确认认证机构

选择合适的ISO 9001认证机构进行申请。建议选择经过认可的、具有良好信誉和经验丰富的认证机构。

咨询和准备

组织可能会选择咨询公司提供ISO 9001认证咨询服务，帮助准备认证过程。在这个阶段，组织需要进行现状评估，确定与ISO 9001标准要求不符合的地方，并进行改进。

编制文件

根据ISO 9001标准的要求，组织需要编制相关的文件，包括质量手册、程序文件、作业指导书等，确保质量管理体系符合标准要求。

内部审核

在提交申请之前，组织需要进行内部审核，以确认质量管理体系的有效性和符合性。内部审核可以由内部审核员或外部咨询公司进行。

提交申请

完成内部审核后，组织可以向所选择的ISO 9001认证机构提交认证申请。申请文件应包括认证范围、质量管理体系文件、内部审核报告等。

认证审核

认证机构会安排审核员对组织进行审核。审核包括文件审核和现场审核两个阶段，审核员将评估质量管理体系的有效性和符合性。

审核报告和认证决定

审核结束后，审核员将提交审核报告给认证机构。认证机构将根据审核报告做出认证决定，决定是否颁发ISO 9001认证证书。

认证证书颁发

如果组织符合ISO 9001标准的要求，认证机构将颁发ISO 9001认证证书，确认组织已通过认证审核。

ISO 9001认证的具体流程可能会因认证机构和组织的情况而有所不同。建议组织在申请认证前，与认证机构进行沟通，了解其具体的认证流程和要求。